Det er vigtigt at rengøre din pool FilterBalls regelmæssigt for at forhindre, at de bliver tilstoppede og ineffektive. Afhængigt af størrelsen på din pool og mængden af brug, den får, skal du muligvis rense dine FilterBalls så ofte som en gang om ugen eller så lidt som en gang om måneden. For at rense dine FilterBalls skal du blot fjerne dem fra filteret og skylle dem af med en slange.
Du kan også lægge dem i blød i en spand sæbevand for en mere grundig rengøring. Sørg for at skylle sæben helt, inden du sætter kuglerne tilbage i filteret.